En 1931, la Universidad de Kentucky emprendió la mejora de ciertas plantas para mejorar los pastos del oeste americano. Después de la selección de los individuos más adaptados, una determinada variedad de los vegetales generados fue comercializada. La planta sembrada formó pronto densas praderas. Sin embargo, los animales hervíboros bovinos mostraron pronto una serie de extraños síntomas: abortos, comportamientos de estrés, caída de la productividad en las granjas, etc. Hoy en día, la variedad de vegetales creada por la Universidad de Kentucky es considerada una peste.

Con el tiempo, se descubrió la causa de éstos males. Un hongo del género Neotyphodium que habita en las plantas y produce alcaloides. Algunos de ellos son tóxicos para los insectos, otros para los mamíferos. La gangrena en las extremidades de los bovinos quedaron explicadas por la presencia de un vasoconstrictor, la ergovalina. El ácido lisérgico, también presente, explicaba el comportamiento extraño y errático del ganado. Éste hongo es invisible a simple vista puesto que coloniza los tejidos de la planta. Se propaga a la descendencia de la planta.

Involuntariamente, los estudios de la Universidad habían llevado a la producción de una planta con reproducción mejorada, pero con la particularidad de ser un veneno para los hervíboros.

Si las plantas se fumigaban y el hongo moría, los hervíboros devoraban la planta sin dejarla crecer en absoluto. En el caso contrario, el hongo mataba a los animales. Había que encontrar un equilibrio dinámico entre los dos extremos. Las plantas y los animales están habitados por microbios que enfrentan sus rasgos.

Ésto ha conducido al concepto de lo Holobionte que se refiere a la unidad biológica compuesta por un hospedador (planta o animal) y de todos sus microorganismos.

Poco a poco, los biólogos van cambiando su visión de organismos aislados, porque todos van acompañados en éste sentido. Es así como el holobionte acumula propiedades del organismo hospedador y de sus huéspedes, así que ésto reúne todos sus genomas. Ésto conduce a la noción de hologenoma, que es una unión entre el genoma del organismo y de sus microbios.

Se podría comparar al Holobionte con un tren muy frecuentado. De entrada, está muy concurrido, puesto que cada organismo organiza a numerosos microbios. Además, ciertos pasajeros eran viajeros puntuales mientras que otros eran abonados que hacían ese trayecto regularmente. De la misma manera, el genoma de los microbios hospedados a veces se transmite de generación en generación y otras veces, no. Esto se relaciona con la teoría endosimbiótica. Los pulmones de las células, las mitocondrias, fueron según ésto bacterias aisladas de la célula eucariota que las alberga. Un Holobionte de libro.